La provincia de Jaén, se caracteriza por la diversidad de microclimas con temperaturas absolutas, que oscilan entre 8.5°C y 36° C, registrándose temperaturas medias y altas en los meses de octubre a diciembre.

En la región de los Andes Septentrionales o Páramos el clima es frío y húmedo con neblinas frecuentes, heladas estacionales y precipitaciones que ocurren con menor intensidad de mayo a agosto, la temperatura fluctúa entre los 6° C a 17° C. Corresponde a esta región el extremo Oeste de la provincia de Jaén, colindante con la provincia de Huancabamba. En esta zona se encuentran: el distrito de Chontalí; a 1500 m.s.n.m., Sallique a 1675 m.s.n.m. y San Felipe a 1850 m.s.n.m.

La zona Yunga Tropical (selva alta) es la zona de bosque montañoso casi permanentemente lluvioso y nublado. El clima es moderadamente templado con intensas lluvias que disminuyen en mayo y agosto. Por encima de los 2500 metros sobre el nivel del mar las temperaturas promedian entre los 6° C a 12° C, mientras que en las zonas de los 2000 metros fluctúa entre los 19° C a 25° C y en las zonas con alturas menores a 1000 metros fluctúa entre los 25° C.

Los distritos que se encuentran dentro de esta región son los siguientes: Jaén, Colasay, Huabal, La Pirías, Pomahuaca, Pucará, San José, del Alto y Santa Rosa.